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BKL (Biobase Knowledge Library) は、BIOBASE 社のデータベースの総称です。BKL には、転写調節関連の TRANSFAC® Suite, パスウェイデータベースの決定版 TRANSPATH®, ヒト・マウス・ラットの全タンパク質の機能に関するデータベース HumanPSD™/GPCR-PD™ 等があります。
  • BKL TRANSFAC® Suite - 転写因子とそのゲノム結合部位に関する世界的スタンダードデータベース
  • BKL TRANSPATH® Professional  - シグナル伝達と代謝経路に関するパスウェイデータベース
  • BKL PROTEOME HumanPSD™ / GPCR-PD™ - ヒト疾患並びにバイオマーカー情報を強化したヒト・マウス・ラットの全タンパク質・遺伝子機能に関するデータベース
  • The ExPlain™ Analysis System - TRANSFAC Suite, TRANSPATH, HumanPSD/GPCR-PD 使用権付き遺伝子・タンパク質発現プロファイル解釈用ソフトウエア

BKL Mammalian は、科学ジャーナルに報告されたタンパク質や疾患等に関する豊富な最新情報をご利用しやすい形で提供いたします。BIOBASE の哺乳類研究用データベースとソフトウエアは、多目的に使用でき、大変高品質です。 そのため、 バイオマーカー同定・遺伝子発現プロファイルの解釈・創薬等の幅広い分野で研究の効率化に貢献します。是非、BIOBASE の総合力を体験してください。

BKL Mammalian + ExPlain は、解析されていないものも含めて(論文報告のない分子に関しては推定情報)、ヒト・マウス・ラットタンパク質の以下のような情報を提供します:

  • Gene Ontology によるキャラクタリゼーション
  • 発現パターン
  • マウスミュータントのフェノタイプ
  • 疾患関連情報(疾患の原因・関連変異やバイオマーカー情報等)
  • シグナル伝達・代謝経路のパスウエイデータと解析ソフト

BKL Mammalian + ExPlain は、多様な情報を収載していますが、その中でも疾患やバイオマーカーに関する情報は、バイオマーカー・治療ターゲット・発症機序の分子メカニズムといった3つのカテゴリーに整理されて、大変利用しやすい形で提供されます。このような特徴を有する哺乳類研究用データベースは、以下のような疑問に迅速ではっきりした答えを出せます:

  • 現在研究中のタンパク質の発現レベルが変動することが知られている疾患は?その遺伝子に変異が起こると発症する疾患は?
  • 例えば、ぜんそくやガンといった疾患で、発現レベルが変動することが報告されている潜在的バイオマーカーは?

BKL のシグナル伝達に関する情報は、詳細で網羅的です。BKL には、ステップ毎の相互関係が詳細に収載されており、パスウェイ描写機能も搭載されます。さらに、あらかじめ多くのコンセンサスパスウェイマップが収載されているので、以下のような疑問に迅速で明快な答えを出します:

  • 現在研究中のタンパク質は、どのようにシグナル伝達経路に関与するのか?
  • 現在解析中のシグナル経路のどの程度の数のタンパク質が、ある特定の疾患と何らかの関係が指摘されているのか?

BKL のユニークなユーザーインターフェイスと BioKnowledge™ Retriever tool を用いれば、広範な情報に簡単にアクセス可能で、何らかの特徴に基づいたタンパク質群の情報も取得可能です。このため、BKL は、以下のような疑問の解決に最適です:

  • 変異が生じた場合にマウスにあるフェノタイプを引き起こすバイオマーカーや創薬ターゲットは?

BIOBASE の BKL 中の全てのデータは、弊社の訓練されたキュレータによるマニュアルキュレーションによっています。現在のところ、text-mining 技術と比較して、マニュアルキュレーションは大変優れておりますので、大変労力とコストのかかる方法でありますが、マニュアルキュレーションによる高品質データベースの維持を行っております。また、BKL には、品質を保証するために、重要な実験の詳細の記載や原著論文へのリンク情報が収載されます。また哺乳類版 BKL の真価は、モデル動物版 BKL と同時にご使用になられた場合に発揮されます。是非、BKL PROTEOME Worm や BKL PROTEOME Yeast と共にご使用になり、BIOBASE の総合力を体験してください。

 
 

 
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