ExPlainによる Key Molecule(s) の同定
ExPlain は、数段階の論理的解析ステップで、潜在的 Key Molecules の同定を可能にします (Fig. 1)。
- 同調的に発現変化した遺伝子群のプロモータを解析し、陰性コントロールとの比較から、これらのプロモータに有意に多く存在する転写因子認識部位を予測
- この転写因子群の情報を用い、同調的に発現変化した遺伝子群に共通なプロモータ構造を予測
- ExPlain 中のパスウェイデータベース TRANSPATH の情報を基に、同定したプロモータ構造に関わる転写因子群を上流で制御可能な特異的 Key Molecules を予測
- この Key Molecules が実際に観察された遺伝子発現パターンの変化に関わるか否かを通常の Wet experiments により確認 (お客様自身による仮説の検証）
ExPlain が予測した仮説は、お客様自身により検証して頂く必要があります。しかしながら、ExPlain に内包されるデータベース (HumanPSD 等） で、これら Key Molecules に関する豊富な情報を迅速に検索できます。これらの情報は、弊社専門家が科学雑誌等からマニュアルキュレーションしたもので、高い信頼性を有しています。このように ExPlain 解析システムは、各ステップで大幅な研究期間短縮に貢献します。また ExPlain システムによる仮説を、Cell Illustrator Online™ でシミュレーションによる検証が可能です。
ExPlain システムは、下流側への影響・上流の重要分子の予測といった解析のみならず、その後の各重要タンパク質・遺伝子に関する情報の収集ステップでも大きな力を発揮します。
ExPlain システムの総合力を是非、ご体験ください。
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