ExPlain™ 解析の最大の利点は、最終的な遺伝子発現パターンの変化に至る上流の原因分子を予測できることにあります。 下流側への影響の予測のみの解析では、不完全な解析になる可能性があります。このような上流の原因分子は、最初のプロファイルで発現が変動している必要がありません。ExPlain™ 解析は、治療ターゲットの探索、薬効メカニズムの解明等に非常に適しています。
是非、ExPlain™ 解析を体験してください。

Affymetrix GeneChip® Compatibility

ExPlain 解析システムは、知識基盤 （発表論文等の情報）に基づいて 複雑な遺伝子発現パターンの変化を解析するシステムです。 ExPlain システムには、Composite Module Analyst (CMA) と呼ばれる genetic algorithm が内包されており、（ Affymetrix GeneChip® arrays 等の結果から得られる） 同調的に発現変化した遺伝子群のプロモータ構造の解析や共通構造の予測に使用されます。ExPlain による解析では、例えば発現が上昇した遺伝子群400遺伝子と発現に変化のなかった400遺伝子群とを比較解析し、発現の上昇した遺伝子群の発現制御領域に有意に多い転写因子認識部位を予測することが可能です。これらの転写因子群の情報を用いて、発現の上昇したものを説明可能なプロモータ (エンハンサーも含む） 構造をモデル化できます。これらの解析ステップで、有意に疑似陽性の比率を減少させることができます。

ExPlain の高精度の予測には、科学雑誌からマニュアルキュレーションされた高品質で専門家向けのデータベース TRANSFAC® の存在が欠かせません。TRANSFAC® は、現在のドイツ本社・社長 (独ゲッティンゲン大学医学部バイオインフォマティクス部門ディレクター兼務) Edgar WINGENDER が、約22年前に趣味で始めたデータベースで、現在まで BIOBASE 社において発展的に維持・管理されています。 現在でも TRANSFAC® は、ExPlain システムで大変重要なデータベースですが、バックグラウンド（陰性コントロール）をとることができない等の点で、ExPlain システムには大きく及びません。是非、弊社の最新解析システム　ExPlain　のパワーを体験してください。

Affymetrix GeneChip® Compatibility について詳しく知りたいお客様は、ロゴをクリックしてください。