BIOBASE の ExPlain™ Plant は、発現プロファイルの総合解析システムで、哺乳類版 ExPlain でおなじみの最新解析方法が植物研究でもご利用になれます。ExPlain Plant を用いてば、例えば、キナーゼ・アダプタタンパク質・受容体等の重要な分子を発現プロファイルの上流に存在する（発現パターンに最終的に成らしめている）原因分子として予測できます。従来の解析方法は、GO terms・Disease terms・Enrichment analysis に代表されますように発現プロファイルの下流側の影響を調べるものです。BIOBASE ExPlain システムは、この伝統的解析法はもとより、上流の原因を予測する解析方法も可能にする総合ソフトウェアです。従来の解析法のみでは、費用のかかる実験の結果の価値を最大化したことにはなりません。是非、ExPlain™ Plant で、最新の解析方法をお試しください。ExPlain™ Plant の特徴は以下のとおりです。

• シロイヌナズナとイネを合わせて、50,000 以上のプロモータ配列のご利用可能
• 転写因子結合部位の詳細な情報とマトリックス（PWM: 新規結合部位の予測に使用）情報のご利用可能
• マイクロアレイ・ChIP-chip・proteomics 等を用いてto build upstream and downstream pathways
• Go beyond traditional microarray analysis to find non-differentially expressed factors influencing gene expression
• Upload promoters from any plant species for binding site analysis
• Connect with our BKL-Plant signaling data for upstream and downstream network analysis or supplement with your own interaction data

Traditional methods for the analysis of signal transduction and gene regulatory networks associated with gene expression data focus on the final products of differentially expressed genes and their effects on the physiology of the cell. These methods do not consider the molecular mechanism(s) that could have caused the experimentally observed changes in gene expression. 

ExPlain Plant users benefit by having the unique ability to generate hypotheses regarding the upstream cause(s) leading to these observed gene expression changes. In particular, ExPlain Plant can identify potential targets that are not necessarily part of your differentially expressed gene set.