TRANSPATH は、シグナル分子・代謝酵素・セカンドメッセンジャー・内在性代謝産物・マイクロ RNA ・それらが関与する反応等に関する情報を収載しています。さらに、TRANSPATH には、互いにクロストークする複雑な反応やパスウェイに関する情報も含まれています。

TRANSPATH は、代謝経路とシグナル伝達経路間のクロストークや、転写因子の活性に影響を与えるシグナル伝達経路、つまり遺伝子発現プロファイルに影響するシグナル経路にフォーカスしています。

TRANSPATH 内のデータは、分子や反応というような分類ごとに階層構造をもち、整理されて収載されています。実験的に証明されている反応や高い結合性を有する反応が、網羅的にキュレーションされています。このような特徴を有するために、一般的な検索はもとより特殊な目的での検索にも最適です。多くの実験的証明がなされている連続反応は、推定シグナル経路とは区別し、信頼性の高いシグナル経路として表示されます。

TRANSPATH は、シグナル伝達経路のある分子の上流の制御因子や下流のターゲットを検索する目的で使用できます。TRANSPATH には、世界的に有名な転写因子関連データベース TRANSFAC やタンパク質機能の網羅的データベース HumanPSD へリンクが張られており、関連情報に容易にアクセスできます。是非、関連データベースと共にご使用になり、BIOBASE の総合力を体験してください。