Products　日本バイオベース

更新 : 2010.11.26


		BIOBASE の主要製品
		ExPlain は、次世代シーケンサーやマイクロアレイ実験により得られた遺伝子発現プロファイル解釈用の最新ソフトウエアです。従来の解析法のみならず、プロファイルの上流に存在する原因分子を予測することができます。従来の解析法で解析済みのデータを再解析することもお薦めです。高額な費用のかかる実験結果の価値を最大化するお手伝いをします。ExPlain mammalian には、それぞれ単品として非常に人気の高いデータベース TRANSFAC Suite, TRANSPATH professional, HumanPSD の使用権が含まれています。

		BIOBASE Knowledge Library (BKL) は、マニュアルキュレーションによる高品質で信頼性の高い BIOBASE 社データベースの総称です。ヒト・マウス・ラットタンパク質・遺伝子機能の最も網羅的データベースの humanPSD/GPCR-PD, 転写因子関連の TRANSFAC, パスウェイデータベースの TRANSPATH 等があります。また酵母・線虫・植物版 BKL もご利用いただけます。

		ヒト・マウス・ラットの全タンパク質の機能についての情報を収載した HumanPSD, G-タンパク質共役型受容体にフォーカスした GPCR-PD, 出芽酵母・分裂酵母・病原性真菌情報の BKL PROTEOME Yeast, 線虫タンパク質の網羅的情報の BKL PROTEOME WormPD 等があります。植物版 PROTEOME は、BKL Plant の項を参照してください。

		BKL TRANSFAC Suite は転写因子・その認識配列・その制御下にある遺伝子に関する世界的に有名でユニークなデータベースです。TRANSFAC に収載される positional weight matrices (PWM) と呼ばれるマトリックスを用いて、転写因子認識部位を高い精度で予測できます。本技術は、ExPlain にも利用されており、世界的スタンダードになっています。

		BKL TRANSPATH は、シグナル分子・代謝関連酵素・セカンドメッセンジャー・内在性代謝産物・miRNA・それらが関与するシグナル系の網羅的情報を収載しており、複雑なシグナル伝達経路と代謝経路に関する緻密で網羅的データベースです。広範で多様な情報は、システムバイオロジストのような専門家にも支持されています。お客様の個別のニーズに対応する受託キュレーションサービスもお薦めです。


		BIOBASE BKL データベースの植物版で、タンパク質や遺伝子機能に関する豊富で高品質な情報が得られます。付属の解析ソフトを用いれば、転写調節からパスウェイ解析まで可能で、植物ゲノムのアノテーションに不可欠のデータベースです。

		植物版 ExPlain で、遺伝子・タンパク質発現プロファイル解析に最適のツールです。最先端の解析法 (The Upstream Analysis) を、植物研究でも利用できます。


		ヒト遺伝病の原因または関連遺伝子変異情報の世界で唯一の網羅的コレクションで、非常に人気の高いデータベースです。ヒト家族性疾患研究・診断等の必須ツールです。無料のPublic 版 (本データベース収載から2.5年以上経過した古いデータのみの利用) と異なり、最新情報を利用できます（ウエールズ・カーディフ大学で開発）。

		生物ネットワークの最先端シミュレーションツールで、TRANSPATH データを取り込むことが可能です。ますます重要性を増しているシステムバイオロジー研究に欠かせないソフトです（東京大学医科学研究所で開発）。
販売単位　（パッケージ・単品）　の表へ