• 疾患、ターゲット、バイオマーカー、パスウェイ、転写調節など創薬研究の必須情報を収載
• 各分野の専門知識を有する専任キュレータが手作業で抽出した高品質なデータ
• 対応する生物種はヒト、マウス、ラットの他に、分裂酵母、出芽酵母、線虫、病原性真菌、植物
• 毎月更新により最新の知見にも対応
• 各種検索機能により高品質なデータを最大限に活用可

科学ジャーナルに日々報告される洪水のように氾濫する情報から、必要情報を取り出すことは困難で、時間のかかる仕事になっています。 しかしながら HumanPSD をご利用していただければ、研究中のタンパク質についての広範で詳細な情報に簡単にアクセス可能です。
さらに、他のタンパク質や疾患との関連についても容易に検索可能です。

HumanPSD は、ヒト・マウス・ラットの全タンパク質に関する最新情報のコレクションで、研究されていないタンパク質に関してましては、推定情報を収載しています。 BIOBASE のアノテーションは、分子機能、生物学的役割、細胞種・組織・臓器における発現パターン、遺伝子変異の結果（マウスタンパク質のみ）、疾患との関連、他のタンパク質・遺伝子との物理的・機能的相互作用等にフォーカスされています。

情報の品質を保証するために、重要な実験結果を原著論文に関する情報と共に収載しています。 この哺乳類にフォーカスしたデータベースの真価は、モデル動物のデータベースWorm やYeastと共に用いた場合に、より発揮されます。

7回膜貫通型受容体は、哺乳類における最も大きなファミリーを形成しています。

7回膜貫通型受容体は、細胞内にシグナルを伝えることで、血圧のコントロールから視力の維持といった幅広い生命現象で重要な働きをしています。 ヘテロ3量体 G タンパク質を活性化することから、7回膜貫通型受容体は、G タンパク質共役型受容体 (GPCR) とも呼ばれます。 その生理的重要性から、GPCR は、創薬の最も重要なターゲットとしても知られています。

GPCR-PD は、HumanPSD に収載される情報を基に、拡充して作られた GPCR にフォーカスした創薬研究に適したデータベースです。

情報の品質を保証するために、重要な実験結果を原著論文に関する情報と共に収載しています。

TRANSPATH は、シグナル分子・代謝酵素・セカンドメッセンジャー・内在性代謝産物・マイクロ RNA ・それらが関与する反応等に関する情報を収載しています。 さらに、互いにクロストークする複雑な反応やパスウェイに関する情報も含まれており、遺伝子発現プロファイルに影響するシグナル経路にフォーカスしています。

TRANSPATH 内のデータは、分子や反応というような分類ごとに階層構造をもち、整理されて収載されています。 実験的に証明されている反応や高い結合性を有する反応が、網羅的にキュレーションされています。 このような特徴を有するために、一般的な検索はもとより特殊な目的での検索にも最適です。 多くの実験的証明がなされている連続反応は、推定シグナル経路とは区別し、信頼性の高いシグナル経路として表示されます。

TRANSPATH は、シグナル伝達経路のある分子の上流の制御因子や下流のターゲットを検索する目的で使用できます。 TRANSPATH には、世界的に有名な転写因子関連データベース TRANSFAC やタンパク質機能の網羅的データベース HumanPSD へリンクが張られており、関連情報に容易にアクセスできます。 是非、関連データベースと共にご使用になり、BIOBASE の総合力を体験してください。

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Mammalian Statistics
	Human	Mouse	Rat
Proteins	18,994	20,013	11,650
Diseases/disease models	2,112	1,282	N/A
Drugs	2,078	153	218
References	161,425	82,190	49,740
GO assignments	191,482	186,959	101,581
Expression assignments	152,025	157,178	94,341
Gene-Disease assignments	37,957	5,792	N/A
Drug-Protein interactions	6,394	217	307
Phenotype assignments	N/A	62,968	N/A
Annotations	323,212	211,082	139,222
Pathway Statistics - All Species
Molecules	135,810
Genes	38,975
Reactions	201,218
Pathways	171
Chains	1,362
References	45,331

Yeast and Worm Statistics
	S. cerevisiae	S. pombe	Fungal Pathogens	C. elegans
Proteins	6,692	4,996	19,932	20,744
References	31,549	4,259	4,435	5,667
GO assignments	67,329	25,548	93,610	76,381
Phenotype assignments	39,243	7,045	2,724	19,373
Annotations	663,971	84,807	72,590	308,763
Expression assignments	−	−	−	8,603
Drugs	144	10	46	12
Drug-protein interactions	206	11	48	14

Plant Statistics
	Arabidopsis	Rice	Maize	Soybean	Sorghum
Proteins	27,062	26,877	1,711	66,298	34,008
GO assignments	179,503	93,257	9,983	241,102	131,188
Expression assignments	951,430	196,969	8,800	−	−
Phenotype assignments	−	2,491	276	−	−
Pathway Statistics - All Species
Reactions	15,51
Pathways	324
References	11,515

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