日本バイオベース(株)-TRANSFAC PROTEOME ExPlain HGMD TRANSPATH 製造・販売-Biobase Japan KK

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よくある質問 Q&A

ExPlain の動作環境や初期設定・全般的な使用方法の情報等について

ExPlain 解析のイメージ PDF
PROTEOME で保存したデータの ExPlain での解析方法
ExPlain のご使用方法習得のためのセッションはこちらから >> 使用方法の情報詳細へ
ExPlain を最初にご使用になるお客様は、必要ファイルを import してください。
import 方法はこちらから >> import 方法へ
64 bit 版 Internet explorer での ExPlain ご使用については、現在 Flash が動作しないためご使用いただけません。問題が生じた場合には info@biobase.co.jp 宛にご連絡ください。

gene set（data set）について

新しい gene set の作製方法（fold change 値を用いて）
１つの遺伝子に複数のProbe が存在している場合、使用する hold‐change 情報の変更が可能です。
デフォルトでは、平均値が使用されています。詳細はこちらから >> gene set（data set）詳細へ

Promoter Analysis について

ExPlain: Promoer 解析 ( F-Match 解析 ) の方法　>> PDF でのご説明
ExPlain system における TSS 情報は、EPD, dbTSS, Fantom, Ensembl データベースの情報を弊社開発の algorithmn で解析して得たものです。 TSSs 決定のイメージはこちらから >> イメージへ

TRANSFAC Professional 基本的使用方法について

転写因子等のターゲット情報の取得方法について

活性化か不活性化等の効果は不明ですが、上流にNF‐kappaB （例）の認識サイトが報告されている遺伝子情報の取得方法はこちらから >> 取得方法へ
直接・間接にNF‐kappaB1 に活性化（transactivation）または、不活性化（transrepression）される遺伝子群の情報の取得方法はこちらから >> 取得方法へ
転写因子結合部位が報告されている遺伝子群の取得方法（STAT1を例にして）はこちらから >> 取得方法へ

TRANSFAC Match の使用方法について

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BKL 使用方法について

Ontology Search の使用方法について

「ヒトでlipase 活性をもつタンパク質は？」を使用例にご使用方法を紹介しています。
使用方法はこちらから >> Ontology Search 使用方法へ
「2型糖尿病の発症に関わるタンパク質で薬のターゲットのなっていないのは？」を例にご使用方法を紹介しています。
使用方法はこちらから >> Ontology Search 使用方法-2へ
「Alzheimer 病に対する薬でターゲットタンパク質の判明しているものの中で、clinical trials の phase が 3または4 のものの検索方法は？」を例にご使用方法を紹介しています。
使用方法はこちらから >> Ontology Search 使用方法-3へ

Genome Trax 基本的使用方法について

HGMD professional 基本的使用方法について

HGMD professional Advanced Search 使用方法について